Kythera heeft een oppervlakte van 284 km². Het is 29 km lang (noord-zuid) en 18 km breed (oost-west). Het eiland maakt deel uit van dezelfde tektonische eenheid als het gebied dat Macedonië, Thessalië, Sterea Hellas, Peloponnesos en Kreta omvat. De belangrijkste kenmerken zijn heuvels en steile kliffen. Er is ook een vallei in het oosten. Kythera behoort tot de Alpenketen en meer bepaald tot de zuidelijke tak van het Tethysische rijk (Papanikolaou, 1986). De zuidelijke tak van het Tethysische rijk omvat de zuidelijke Alpen, de Apennijnen, de Dinarische Eilanden, de Tauriden, de Iraniden en delen van andere ketens die de Himalaya raken. De geologische basis van Kythera wordt gevormd door de tektonische eenheden van Arna, Tripolis en Pindos. Alleen het oostelijke deel van het eiland is gevormd door meer recente afzettingen.
Geologische kaart van Kythera (Grieks Instituut voor Geologische Studies 2001 Ι.Γ.Μ.Ε)
