La fauna de Citera no es tan rica. En lugares más apartados, como valles o donde la vegetación es más densa, se encuentran más especies. Hay mamíferos, aves, invertebrados, serpientes y otros. Algunos de ellos son: el erizo, el murciélago enano, la liebre, la rata, la mofeta. Los mamíferos relacionados con la ganadería son la oveja, la cabra, la vaca y el cerdo, mientras las aves relacionadas con la avicultura son las gallinas y los pavos.
Aves
La isla de Citera, geográficamente, constituye una escala en el trayecto de las aves migratorias que en invierno abandonan Grecia para dirigirse más al sur, hacia África. En la isla se han observado más de 200 especies de aves, la mayoría de ellas migratorias, mientras hay también unas 20 que viven permanentemente en la isla. Algunas de éstas son: el gorrión, la cardelina, la perdiz, el cuervo, el mirlo, la gaviota, el halcón de Eleonor, el neblí negro. Algunas de las migratorias son: la abubilla, la collalba rubia, el alcaudón dorsirrojo, el cernícalo primilla, el milano negro, el águila, el halcón peregrino, la chocha perdiz (becada), el zorzal común, la codorniz, la cerceta carretona, la tórtola europea, la golondrina común, la lavandera, la oropéndola.
Reptiles y anfibios
Las especies de reptiles que viven en Citera son el Cyrtodactylus kotschyi, la salamanquesa rosada, el lución, el lagarto griego, algunas serpientes y tortugas. Los anfibios viven en charcos, lagos y torrenteras. Una de sus especies es la rana.
Invertebrados
La abeja es un insecto muy importante para la isla de Citera. La saturnia pavonia, la mariposa nocturna de Europa, se encuentra en Citera. Otros invertebrados son: el saltamontes, la mariposa, el gusano, la mosca, el escarabajo, el caracol, el escorpión, la cucaracha.
