Η Πανίδα των Κυθήρων δεν είναι αρκετά πλούσια. Σε πιο ερημικές περιοχές, όπως σε λαγκάδια κι επίσης όπου η βλάστηση είναι πιο πυκνή, συναντούνται περισσότερα είδη. Υπάρχουν θηλαστικά, πτηνά, ασπόνδυλα, ερπετά και άλλα. Μερικά από αυτά είναι: ο σκαντζόχοιρος (erinaceus concolor), η νανονυχτερίδα (Pipistrelus Pipistrelus), ο λαγός (lepus capensis), ο ποντικός (Mus musculus), το κουνάβι (Martes foina). Τα θηλαστικά που έχουν σχέση με την κτηνοτροφία είναι το πρόβατο, η αίγα, η αγελάδα και ο χοίρος, ενώ από πτηνά, είναι οι όρνιθες και οι γαλοπούλες.
Πτηνά
Τα Κύθηρα γεωγραφικά αποτελούν μεταναστευτικό σταθμό στη διαδρομή των αποδημητικών πουλιών που το χειμώνα αφήνουν την Ελλάδα και κατευθύνονται νοτιότερα, προς την Αφρική. Στο νησί έχουν παρατηρηθεί πάνω από 200 είδη πτηνών, από τα οποία τα περισσότερα είναι αποδημητικά ενώ υπάρχουν πάνω από 20 διαμένουν σε αυτό μόνιμα. Μερικά από τα μόνιμα είναι ο σπουργίτης (Passer domesticus), η καρδερίνα (Carduelis carduelis), η πετροπέρδικα (Alectoris graeca), το κοράκι (Corvus corax), το κοτσύφι (Monticola), ο αιγαιόγλαρος (Larus audolinii), η γερακίνα (Buteo buteo), ο μαυροπετρίτης (Falco eleonorae). Μερικά από τα μεταναστευτικά είναι ο τσαλαπετεινός, η ασπροκώλα, ο κεφαλάς (Lanius), ο κίρκος (circus), ο τσίφτης (milvus migrans), ο αετός (Aquila), ο πετρίτης (Falco Pelegrinus), η μπεκάτσα (Scolopax rusticola), η τσίχλα (Turdus philomelos), το ορτύκι (Coturnix coturnix), η σαρσέλα (Anas querquedula), το τρυγόνι (streptopelia turtur), το χελιδόνι (Hirundo rustica), η σουσουράδα (Motacilla), ο συκοφάγος (Oriolus oriolus).
Ερπετά και Αμφίβια
Τα είδη ερπετών που υπάρχουν στα Κύθηρα είναι ο κυρτοδάκτυλος (Kyrtopodion kotschyi), το σαμιαμίδι (Hemidactylus turcicus), το κονάκι (Anguis cephallonica), η σαύρα (Lacerta graeca), διάφορα φίδια και χελώνες. Τα αμφίβια ζουν σε νερόλακκους, λίμνες και ρέματα. Τέτοιο είναι ο βάτραχος (Rana graeca)
Ασπόνδυλα
Η μέλισσα είναι ένα από τα πιο σπουδαία έντομα για τα Κύθηρα. Η σατούρνια (Saturnia pavonina) η μεγαλύτερη νυχτοπεταλούδα της Ευρώπης συναντάται και στα Κύθηρα. Άλλα ασπόνδυλα είναι: η ακρίδα, η πεταλούδα, ο σκώληκας, η μύγα, το σκαθάρι, το σαλιγκάρι, ο σκορπιός, η κατσαρίδα.
