Citera dispone de un puerto seguro en el área de Diakofti, al nordeste de la isla. El puerto opera desde 1996 y puede atender por completo todas las necesidades de la isla. Se conecta con Citera capital y el Aeropuerto mediante una carretera de alta velocidad. Dista 30 km. de Citera capital y 9 km. del aeropuerto de la isla.
La construcción del puerto de Citera, que empezó en 1982, fue inspirada por Gregorio Kasimatis y la decisión de su creación fue ratificada en una Asamblea general que se celebró en Citera capital.
Puertos – refugios turísticos hay también en Agía Pelagía, en Kapsali, en Avlémonas y en Platiá Ammos. Kapsali funciona como marina mientras a la vez constituye una escala para los cruceros del Mediterráneo.