La faune de Cythère est peu riche. La plupart des espèces fauniques se trouvent dans les endroits les plus déserts, comme les vallons, ainsi que dans les endroits où la flore est abondante. Il y a des mammifères, des oiseaux, des reptiles, des invertébrés et autres. Parmi eux le hérisson (erinaceus concolor), la chauve-souris naine (pipistrellus pipistrellus), le lapin (lepus capensis), la souris (mus musculus) et la fouine (martes foina). Les mammifères utilisés dans l’élevage sont les moutons, les chèvres, les vaches, les cochons, et parmi les volailles, les poules et les dindes.
Les oiseaux
Cythère est un lieu de repos pour les oiseaux migrateurs qui en début d’hiver quittent la Grèce pour le Sud et l’Afrique. L’île abrite plus de 200 espèces d’oiseaux, dont la plupart sont migrateurs. Environ 20 espèces habitent Cythère durant toute l’année. Parmi les espèces permanentes il y a le moineau domestique (Passer domesticus), le chardonneret domestique (Carduelis carduelis), la bartavelle (Alectoris graeca), le grand corbeau (Corvus corax), le monticole (monticola), la mouette de la mer Egée (Larus Audouinii), la buse variable (Buteo buteo) et le faucon d’Eléonore (Falco eleonorae).Parmi les visiteurs migrateurs de l’île, on trouve la huppe fasciée (Upupa epops), le pie-grièche (Lanius), le traquet oreillard (Oenanthe hispanica), le busard (Circus), le milan noir (Milvus migrans), l’aigle (Aquila), le faucon pèlerin (Falco pelegrinus), la bécasse des bois (Scolopax rusticola), la grive musicienne (Turdus philomelos), la caille des blés (Coturnix coturnix), la sarcelle d’été (Anas querquedula), la tourterelle des bois (Streptopelia turtur), l’hirondelle de cheminée (Hirundo rustica) et le loriot d’Europe (Oriolus oriolus).
Reptiles et amphibies
Les espèces de reptiles que l’on trouve à Cythère sont le gecko nocturne (Cyrtopodion kotschyi et Hemidactylus turcicus), l’orvet grec (Anguis Cephalonica), le lézard grec (Lacerta graeca), plusieurs sortes de serpents (non venimeux) et les tortues. Les amphibiens, comme par exemple la grenouille grecque (Rana graeca) vivent dans les petits lacs et ruisseaux.
Invertébrés
L’abeille est un des insectes les plus importants pour Cythère. Le petit paon de nuit (Saturnia pavonia), qui est le plus grand papillon de nuit en Europe existe aussi à Cythère. Autres invertébrés sont la sauterelle, le papillon, la mouche, le scarabée, l’escargot, le scorpion et le cafard.
