La grande église du château de Chora s’appelle Panagia Myrtidiotissa est a été bâtie en 1580 par les Vénitiens. C’était un temple catholique, initialement dédié à la « Vierge des Latins ». En 1806 elle a été transformée en église orthodoxe et dédiée à Panagia Myrtidiotissa. L’icône de Myrtidiotissa était gardée dans cette église protégée, par peur d’être volée par les pirates. En 1842 l’icône a été retournée au monastère de Myrtidia.

Près de cette église, est situé le petit temple de Panagia Orfani, appartenant à la famille Kalonas. Elle abrita pendant près de 300 ans l’icône et les objets religieux du monastère Agarathos situé Iraklio en Crète quand la Grande île était sous occupation turque.